Resolvido! Eu pensei que adicionando um papel de parede (3840x2160) que não era exatamente o mesmo tamanho da minha configuração de monitor duplo (3840x1080), o Ubuntu teria ajustado, mas isso não aconteceu.
Por isso, pesquisei papéis de parede de 3840x1080, ampliei-os no painel Tweak Tool e agora funciona. Mas ainda assim me confunde que, quando eu estava em Atividades ou no Show Application, o papel de parede estava perfeitamente definido em segundo plano.