Você pode conseguir isso com gdevilspie
Não abra em cima de todas as janelas e distraia-me enquanto estou trabalhando em outra tarefa; em vez disso, exiba uma notificação no painel lateral para abrir essa janela quando quiser (quando eu terminar minha tarefa atual)
Esse programa não se importa com o que estou fazendo no momento, ele só abre rude na minha cara e cobre tudo.
Isso parece um problema muito pequeno, mas acontece comigo quase todos os dias e já começou a me irritar.