Na documentação do CUDA, fomos aconselhados a usar o comando setenforce 0 no SELINUX. Isso funcionou uma vez para mim (na execução de amostras CUDA).
Em outros fóruns, fomos aconselhados a trabalhar com superusuário, usando sudo su de sudo COMMAND e isso sempre funcionou.
Eu tive outro problema ao compilar os exemplos CUDA, mas corrigi-os adicionando essas linhas ao meu ~\.bash_rc :
LIBRARY_PATH=/usr/lib/nvidia-355:${LIBRARY_PATH}
export LIBRARY_PATH
Fomos aconselhados a usar:
$ LIBRARY_PATH=/usr/lib/nvidia-355:${LIBRARY_PATH} make
Mas eu não entendo isso por enquanto.