Quais vantagens realmente traz para ter uma partição alinhada em um SSD?
Basicamente, é tudo sobre melhor desempenho. Se é realmente um grande problema com a geração atual de SSDs - quem sabe, mas alinhar a partição não vai doer.
De qualquer forma, o instalador do Ubuntu automaticamente alinha as partições corretamente. A primeira partição começa no setor 2048, ou seja, após 2048 setores, 512 bytes = 1 MiB e 1 MiB é dividida de maneira uniforme por todos os tamanhos comuns de blocos de SSD.