Qualquer diretório que comece com a. é um diretório oculto.
De um gerenciador de arquivos que você deseja selecionar mostrar oculto (clique com o botão direito do mouse ou no menu superior sob visualização)
Por exemplo, se você abrir um terminal, ele será aberto em seu diretório pessoal.
Se você digitar
ls
Isso mostrará o que você normalmente veria em um gerenciador de arquivos, mas se você
ls -a
Você verá todos os arquivos de pontos ocultos.