Isso é um comportamento normal. O driver do sistema de arquivos usado para montar partições NTFS no Ubuntu é 'ntfs-3g', que sempre espera que o (s) sistema (s) de arquivos NTFS estejam em estado limpo. Sempre que você hiberna o Windows 7, por design, o Windows sempre marca todas as partições NTFS como sujas. Então, da próxima vez que você inicializar o Ubuntu com o Windows 7 em estado de hibernação, ele encontrará essas partições NTFS em estado sujo e irá reclamar. É altamente recomendado NÃO fazer reparos no fsck em partições NTFS hibernadas no Ubuntu. Você não pode e não deve usar uma partição NTFS no Linux que estava em hibernação ou até mesmo não desligar o Windows corretamente levará a queixas fsck. Sempre desligue o Windows corretamente antes de usar as partições do NTFS no Ubuntu.