A principal causa disso é quando você salva um arquivo do LibreOffice diretamente na pasta do Ubuntu One. O que acontece é que LO auto-limpa de vez em quando, e se isso acontece enquanto você está enviando um arquivo para U1, então você pode ter três cópias diferentes. Existe realmente um conflito, então o Ubuntu mantém todos eles. Eles são renomeados para filename.u1conflict para que você possa ver as idades deles e renomeá-los.
Uma "solução" é desativar o salvamento automático no LibreOffice. Outra é salvar em uma pasta não sincronizada e copiá-la de vez em quando. Eu pessoalmente escolho o último, embora nenhuma das abordagens seja perfeita. Eu acho que nós realmente precisamos de uma extensão do Ubuntu One para o LibreOffice funcionar realmente bem.