Ao colar um texto, muitas vezes ele não cole o texto copiado mais recentemente, mas algo de antes. Isso acontece mesmo quando copiando e colando dentro do mesmo aplicativo.
Estou usando o 15.04, mas também tive esse problema em 14.10. Eu tentei usar outros gerenciadores de área de transferência (glipper / clipit) e o problema persiste. Eu também tentei instalar o parcellite.
De acordo com o clipit, copiar o texto sempre é registrado, mas às vezes não consigo colar. Normalmente, o que eu preciso fazer é apertar o botão Ctrl + c e depois funciona.
Além disso, às vezes, torna-se impossível selecionar o texto. A seleção desaparece imediatamente após a liberação do mouse / teclado (na maioria das vezes em gedit e nautlius). Isso pode ser um problema não relacionado, no entanto.
Frequentemente alterno entre o Unity e o i3wm e nunca tive nenhum desses problemas em i3wm.
Como sugerido por Jos nos comentários, a desinstalação do indicador Pushbullet resolveu o problema. Agora estou usando a extensão pushbullet do Firefox / Chrome (com a cópia universal e a pasta desativada) e agora tudo está funcionando bem.
Obrigado!