O seu relógio de hardware está provavelmente configurado para UTC. Para verificar:
grep UTC /etc/default/rcS
Isso deve lhe dar algo como:
# Set UTC=yes if your system clock is set to UTC (GMT), and UTC=no if not.
UTC=no
... com o UTC sendo sim ou não. Você provavelmente precisará configurar isso.
Leia aqui como configurar o ntpd para tenha sempre a hora certa.