Com as informações limitadas que você deu, é difícil dizer. Você pode fazer o seguinte:
- Inicie o Ubuntu a partir de um liveCD ou pendrive.
- Abra o Utilitário de Disco (basta digitar o nome no traço)
- Selecione seu disco rígido, clique no ícone de roda dentada - > Dados e testes SMART.
Lá você pode ver o estado do disco, temperatura e quaisquer erros e falhas que ele tem.
Você pode até verificar problemas com o botão Iniciar Autoteste.