A situação em que os dois atalhos usam a mesma chave não deve acontecer; quando tentei suas configurações, recebi uma solicitação para confirmar que a captura de tela da tela inteira estava desativada.
Então eu tenho isso:
Para armazenar tal configuração no banco de dados do dconf, você pode usar a linha de comando. Abra um Terminal ( Ctrl + Alt + t ) e digite os seguintes comandos:
gsettings set org.gnome.settings-daemon.plugins.media-keys area-screenshot 'Print'
gsettings set org.gnome.settings-daemon.plugins.media-keys screenshot ''
Você pode até mesmo atribuir a
gsettings set org.gnome.settings-daemon.plugins.media-keys screenshot '<Shift>Print'
Agora você pode fazer logout e login e manter sua configuração desejada.