Veja aqui para instruções sobre como iniciar no modo de recuperação (não sei como isso se aplica a uma sessão de VM):
- Pressione e segure a tecla Shift após o término da bios para exibir o GRUB
- Escolha a linha "Opções avançadas"
- Encontre a entrada para sua versão do kernel que termina em "(modo de recuperação)"
- Após alguns momentos, outro menu com algumas opções será exibido. Selecione "Ir para um prompt do shell de root"
Neste ponto, você terá acesso ao shell como root e sua partição root será montada como somente leitura. Isso deve permitir que você limpe o diário nesta partição.