Eu tive um problema parecido no Xfce e onde o goldendict continuava abrindo na inicialização. Para resolver isso, você vai para a sessão e a inicialização das configurações e vai para a guia autostart do aplicativo. Em seguida, vá para adicionar e faça o nome e a descrição que você quiser. Sob o comando colocar killall (nome do programa). Adicione isto para qualquer programa que você não queira na inicialização. Além disso, em geral, você pode desmarcar a opção Salvar sessão automaticamente no logout. Na guia da sessão, talvez você queira limpar as sessões salvas.