Se você maximizar o nautilus e, em seguida, fechá-lo, na próxima vez em que você o abrir, ele será maximizado. Eu acho que é isso que você está perguntando. Caso contrário, por favor, explique o que você está tentando realizar.
Quando abro o diretório de um arquivo, o Nautilus é aberto minimizado. Como faço para abrir na maximizada como janela principal?
Se você maximizar o nautilus e, em seguida, fechá-lo, na próxima vez em que você o abrir, ele será maximizado. Eu acho que é isso que você está perguntando. Caso contrário, por favor, explique o que você está tentando realizar.