Para fazer um benchmark de um disco, é melhor garantir que ele seja desmontado (tanto para resultados precisos quanto para segurança). Eu costumo usar o utilitário de discos para isso em 12.04, 14.04 e 16.04, mas esse utilitário parece buggy em 13.xx. Há uma série de outras boas sugestões para benchmarking encontradas aqui: Como verificar o desempenho do disco rígido