A resposta de Javier Rivera funciona, mas demora bastante para o rsync verificar e comparar todas as somas de verificação dos arquivos. Descobri que usar a seguinte opção funcionou melhor para mim:
rsync -rtv --modify-window=1 /source /dest
A opção --modify-window=1
permite uma variação de ± 1s nos timestamps. Com esta opção ativada, a comparação do registro de data e hora será mais branda e examinará as minúsculas diferenças de tempo entre os sistemas de arquivos NTFS / FAT e Unix.
Origem (ger): link
P.S .: Por favor, esteja ciente de que o horário de verão causará transferências completas de arquivos duas vezes por ano. Consulte aqui para obter mais detalhes e possíveis soluções.