Conecte seu disco rígido. Abra Disk Utility . Escolha a unidade. No formato Type , você terá a opção ext2 formatada. [Você pode precisar desmontá-lo antes de formatar]
OR
você pode instalar o gparted e formatar a partição desejada. Você precisa instalar o gparted eu acho. Apenas faça sudo apt-get install gparted .
EDIT: Eu mesmo recomendaria ntfs para qualquer outra partição se você tiver que acessá-la no Windows. Ou crie uma partição em ntfs e outra em ext4 na base de armazenamento 50-50.