Não tenho certeza sobre o Unity, mas no XFCE eu uso wmctrl
com um atalho de teclado.
Basicamente você cria um atalho de teclado personalizado, o meu é CTRL-ALT-t
e o envia para o programa. O comando para o aplicativo trazer para o topo é:
wmctrl -r :ACTIVE: -b toggle,above
Você provavelmente terá que instalar o wmctrl
primeiro, pois não acho que ele seja padrão:
sudo apt-get install wmctrl
O crédito vai para fórum do Ubuntu