Há muito trabalho sendo feito sobre esses problemas. A mudança de layout foi realmente quebrada pela atualização de 13.04 para 13.10, e embora a maior parte tenha sido corrigida, ainda há problemas.
O bug geral com links para todos os outros está aqui: link
Existe um problema semelhante ao que você mencionou com Ctrl + Shift aqui: link
Lendo link parece que seu problema pode ser corrigido adicionando o PPA experimental da attente. Mas existem relatórios conflitantes ao redor.
Se precisar de ajuda para adicionar um PPA, veja link