Quando você está na seção "algo mais" do instalador.
Altere a partição do Linux ext4.
Defina o ponto de montagem como "/".
Eu também digo para formatá-lo também, apenas para estar seguro.
Configurar o ponto de montagem para "/" instalará todo o Ubuntu nessa partição ext4. As outras opções são para fazer partições diferentes para diretórios diferentes. Um comum é ter "casa" em uma partição separada. Isso não é necessário, mas pode ser útil se o sistema operacional for eliminado; seus arquivos pessoais estarão seguros.
Verifique se a inicialização está definida para a unidade correta. Eu não sei como você tem seus discos configurados.
Clique em next / ok / whatever e você estará no caminho para o Ubuntu 13.10.