Para quem estiver vendo o post acabei apenas roteando os pedidos usando o iptables:
Algo como
iptables -t nat -A PREROUTING -p udp -d 192.168.0.12 --dport 14000 -j DNAT --to 192.168.0.12:9
com a porta 14000 encaminhada no meu roteador me permitiu usar o WoL pela Internet na porta 14000.