Em vez de esperar, você pode fazer o download do Gromacs mais recente e instalá-lo. Após o download, certifique-se de ter todos os pré-requisitos atendidos e pressione Ctrl + Alt + T no teclado para abrir o Terminal. Quando se abre, navegue para onde o arquivo foi baixado (provavelmente a pasta Downloads), execute o comando abaixo:
tar xfz gromacs-4.6.1.tar.gz
cd gromacs-4.6.1
mkdir build
cd build
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON
make
sudo make install
Para informações mais detalhadas e como atender aos pré-requisitos, consulte as Instruções de instalação