Seu problema é que o GDM está iniciando duas vezes no console . O GDM é um gerenciador de exibição de login mais pesado que o LightDM (e é por isso que ele é chamado LightDM), portanto, ele pode resolver seu problema de inicialização do GDM duas vezes a partir do console se estiver no console:
sudo start lightdm
Mesmo se você estiver usando o GDM por padrão, você ainda tem o LightDM instalado, então este comando deve funcionar.
No Ubuntu 15.04 e posterior, execute este comando:
systemctl start lightdm.service