A aceleração 2D nos gráficos da Intel tem sido um pouco instável ultimamente. Difícil de duplicar, mas parece ter feito o seu caminho para o upstream - eu estava tendo os mesmos problemas em Edgers há algumas semanas que vocês agora estão tendo em estável, e meus problemas foram esclarecidos enquanto isso.
A solução por enquanto (se você não quer mudar para uma filial instável em busca de estabilidade) não é usar aceleração 2D em qualquer aplicativo (o Skype e o VLC também são proeminentes, mas acredito que ambos permitem que você desligue). Isso causará um uso da CPU um pouco maior, mas sem outros problemas.