Aria2 é um aplicativo de terminal, mas tem um webgui que você pode usar ... se você pode colocar a sua instalação do webgui on-line, então você pode usar isso ou se você está apenas trabalhando de uma LAN, então poderia funcionar dessa maneira também ... embora de qualquer forma você precise usar ssh ou algo no computador para usar essas coisas.
Não existe uma solução simples no momento, mas o Aria2 permite o controle remoto por meio do RPC. - link