O que você precisa fazer é configurar suas preferências de gerenciamento de energia para o usuário do gdm. Para fazer isso a partir da linha de comando, use este comando para fazer a janela de preferências aparecer quando você sair ou trocar de usuário:
sudo cp /usr/share/applications/gnome-power-preferences.desktop /usr/share/gdm/autostart/LoginWindow/
Agora efetue logout, reinicie ou troque de usuário e você deve obter a janela de preferências de gerenciamento de energia. (Eu fiz, eu acabei de testar isso)
Depois de configurar suas preferências como você gosta delas, faça login novamente e remova o arquivo de início automático da área de trabalho:
sudo rm /usr/share/gdm/autostart/LoginWindow/gnome-power-preferences.desktop
Veja como você gerencia um laboratório, você vai querer saber como duplicar essas configurações para todos os compiladores em sua rede sem suar o dia todo. Simplesmente sincronize o diretório /var/lib/gdm/.gconf
com seus outros computadores (eu tenho scripts automatizados para fazer isso na minha rede, você também pode)
Você pode executar esse truque com vários aplicativos de configuração diferentes, veja o que é o início automático, no diretório acima, para ver que tipo de serviços estão disponíveis. É possível alterar o tema e o papel de parede dessa maneira também, mas você pode usar o gdm2setup, um aplicativo de terceiros para fazer um pouco disso.