Acho que você respondeu sua própria pergunta, os drivers usados para controlar os discos SATA são normalmente bem genéricos - a menos que você esteja usando hardware especial - e faça o mesmo no Windows e no Linux.
Se esta unidade estiver lenta no Windows, ela provavelmente ficará lenta em qualquer sistema Linux. Você deve substituí-lo ou verificar se a Samsung possui uma atualização de firmware que eventualmente resolveria esse problema.
Lembre-se de que quando mudei de uma unidade de placa giratória para um SSD, não há comparação no acesso a inicialização e aplicativos. Este é um problema de modelo de disco e deve ser tratado com a Samsung.