Se você instalou o memcached a partir do centro de software ou dos repositórios padrão (o que é altamente recomendado!), você pode reiniciá-lo usando:
service memcached restart
Se o seu servidor java fornecer um script inicial, você deverá ser capaz de usar um comando semelhante para isso. Se não, você poderia potencialmente escrever um script para automatizar seus comandos.