Adicione a seguinte linha a /etc/rc.local a ser executada na inicialização:
dconf write /org/gnome/desktop/wm/preferences/mouse-button-modifier '"<Super>"'
Isso deve mudar a tecla modificadora para não interferir na opção do mouse em três botões do Blender (tecla alt ).
Para remover a modificação, exclua a linha em rc.local e execute o comando novamente com <Alt> em vez de <Super> .