Eu recomendaria se você já atualizasse o sistema com os pacotes mais recentes (e também instalasse os drivers proprietários para sua placa de vídeo se isso se aplicasse) instalando o powertop :
sudo apt-get install powertop
Em seguida, execute-o a partir de um terminal assim: sudo powertop
Ele vai te mostrar o que está usando tanto poder. Se você pressionar a tecla de seta para a direita e ir para a última opção chamada "Tunables", ela deverá mostrar quais otimizações você pode fazer para diminuir a temperatura.
Além do powertop, há também alguns outros como Jupiter e TLP. Mas essas são melhor explicadas neste post: É necessário limpar / otimizar o sistema