Eu usaria o ssd mais lento também. O Ubuntu inicializa rápido, então não importa qual você escolher. Você não notaria a diferença de qualquer maneira (a menos que você faça alguns benchmarks).
Eu tive um SSD toshiba de 128GB no meu T400 e acabei de comprar um novo SSD Intel de 240GB (série 335). Eu quero ter uma nova instalação de inicialização dupla limpa do Ubuntu e do Windows 7.
Com o meu sistema SATA II, o novo SSD da Intel provavelmente deve ser de 1,3 a 1,5 vezes mais rápido na leitura do buffer e pelo menos duas vezes mais rápido na leitura em cache. Agora preciso saber qual montar para meu diretório pessoal e qual usar para as instalações do SO.
Opção 1) Use SSD mais rápido para windows + linux + home e use o outro SSD para espaço extra.
Opção 2) Use SSD mais rápido para Windows + Linux e monte em casa no outro SSD.
Opção 3) SSD mais lento do usuário para windows + linux e mount home no outro SSD.
Opção 4) Algum tipo de configuração de matriz RAID.
Programas típicos no linux: Chrome, Thunderbird (pesado), download de torrent ocasional. Windows: Starcraft II.
Eu usaria o ssd mais lento também. O Ubuntu inicializa rápido, então não importa qual você escolher. Você não notaria a diferença de qualquer maneira (a menos que você faça alguns benchmarks).
Eu usaria o SSD mais lento para casa. A maioria do que está armazenado lá são arquivos de configuração e arquivos pessoais (mp3s, docs, etc). Isso deixa o mais rápido para executar seu sistema operacional e aplicativos. Mas sinceramente duvido que um teste ocular seja capaz de dizer a diferença de qualquer forma.