Este parece ser um bug que afeta o software Gnome. Veja este link no launchpad: link Eu recebo exatamente o mesmo em ambas as minhas máquinas Ubuntu 12.10 a partir do prompt de comando, mas o gedit funciona como pretendido. Se você está tendo alguma dificuldade em editar o arquivo ddclient.conf, você pode tentar o nano que abre dentro da janela do terminal, mas caso contrário, eu ignoraria a mensagem de aviso neste caso.