O OP relatou nos comentários que ele não havia removido os drivers antigos antes de instalar os novos drivers da Nvidia, e que remover os drivers antigos resolveu o problema.
Acabei de instalar o Ubuntu 12.04 e minha tela não está de alguma forma centralizada. Moveu uma ou duas polegadas para a direita do monitor. Eu só vejo metade do desligamento, reinicie, mude as opções do usuário (felizmente eu vejo o suficiente para desligar o computador).
O OP relatou nos comentários que ele não havia removido os drivers antigos antes de instalar os novos drivers da Nvidia, e que remover os drivers antigos resolveu o problema.