No Precise, o processo dnsmasq controlado pelo NetworkManager entra em conflito com o servidor dnsmasq independente em sua configuração padrão. Este foi o bug # 959037.
No Quantal, o processo dnsmasq controlado pelo NetworkManager atende no 127.0.1.1, em vez de no 127.0.0.1. Consequentemente, é possível, no Quantal, executar o dnsmasq autônomo, atendendo em todas as interfaces, incluindo lo em 127.0.0.1, ao lado de NM-dnsmasq. Na configuração padrão, o dnsmasq independente encaminhará as consultas para o NM-dnsmasq, que encaminha as consultas para fora da máquina, conforme determinado pelo NetworkManager.
A resposta para a pergunta "Como posso alterar o dnsmasq ou o gerenciador de rede ..." é que você não pode fazer a alteração desejada no Precise sem recompilar o NetworkManager. No Quantal, o dnsmasq controlado pelo NetworkManager pode ser configurado via arquivos em /etc/NetworkManager/dnsmasq.d /.