Enquanto você pode ter o disco inteiro , ou uma partição, é impossível usar dd para colocar algumas partições (seletivamente) em um arquivo. Isso exigiria o retrabalho da tabela de partições da imagem. Você pode, no entanto, copiar seletivamente várias partições para separar arquivos. Vamos copiar /dev/sda1 e /dev/sda3 abaixo:
sudo dd if=/dev/sda1 of=/media/HARDDISK/sda1.img
sudo dd if=/dev/sda3 of=/media/HARDDISK/sda3.img
Isso cria dois arquivos no diretório de sua escolha (veja o segundo argumento). Tenha cuidado para não confundir if e of , pois você pode destruir dados se cometer algum erro.