Acontece que o Launcher deve permanecer aberto em espaços de trabalho sem janelas. Dois de meus espaços de trabalho tinham janelas maximizadas que o Unity não parecia estar percebendo, e quando fechei as janelas e depois reabrei-as, o Launcher voltou ao seu comportamento de auto-ocultar correto.
Talvez alguém também possa simplesmente mover a janela para outro espaço de trabalho e voltar para o desbloqueador do Launcher - eu não pensei em tentar isso.