Para resolver esse problema em 12.04 e continuar usando as ferramentas do modo laptop edite o arquivo:
/etc/laptop-mode/conf.d/usb-autosuspend.conf
$ sudo gedit /etc/laptop-mode/conf.d/usb-autosuspend.conf
E procure a linha:
AUTOSUSPEND_USBTYPE_BLACKLIST=""
Substitua por:
AUTOSUSPEND_USBTYPE_BLACKLIST="usbhid usb-storage"
Isso desativará automaticamente a suspensão USB se você tiver QUALQUER mouse e até mesmo unidades USB conectadas.