Abra o arquivo tint2 conf:
gedit ~/.config/tint2/tint2rc
Encontre a seção #Panel e assegure-se de definir essas variáveis da seguinte forma:
panel_dock = 0
panel_layer = bottom
Encontre a seção # Panel Authoide e defina:
strut_policy = follow_size
Encontre mais dicas úteis aqui