Se você puder descriptografá-lo na inicialização antes de carregar o Wubi, então sim, caso contrário, não.
Por exemplo O Safeboot pode fazer isso, mas ymmv. Como sempre, faça backup dos seus arquivos regularmente.
Eu tenho um laptop com o Whole Disk Encryption. Ainda posso instalar usando o Wubi?
Se você puder descriptografá-lo na inicialização antes de carregar o Wubi, então sim, caso contrário, não.
Por exemplo O Safeboot pode fazer isso, mas ymmv. Como sempre, faça backup dos seus arquivos regularmente.