O Python é um "intérprete", semelhante ao Java, por exemplo. Ele executa aplicativos. Qualquer aplicativo que esteja escrito na linguagem de programação Python será executado por um processo python. Isso significa que dizer "python está rodando 90%" não nos diz muito. Significa simplesmente "alguma aplicação está em execução".
Nesse caso, no entanto, você forneceu uma dica. A caixa de seleção é o programa real do Python que está sendo executado. É um sistema para testar diferentes tipos de software. Ele é usado para o teste do sistema, que é usado para testar o suporte de hardware, entre outras coisas.
A desinstalação de um aplicativo não sai do aplicativo (caso contrário, a atualização do sistema enquanto ele estiver em execução seria impossível), portanto, mesmo que você tenha desinstalado o teste do sistema, ele ainda estará em execução. É difícil saber exatamente por que não desistiu. Há muitas incógnitas. No entanto, se você sair e voltar, o problema desaparecerá. Ou se você tivesse que inserir sua senha ao executar o teste (executando-o como o usuário 'root'), uma reinicialização sairá desse aplicativo se ele não for interrompido.
Caso contrário, você pode abrir o System Monitor e encontrar o processo Python executando a instância "checkbox". Então você pode clicar com o botão direito e matá-lo.