Use o gconf-editor para navegar até os perfis de apps > gnome-terminal > e selecione o perfil que você alterou. Nesse caso, você poderá remover o comando personalizado.
Se o gconf-editor não estiver instalado, mude para um console via CMD + ALT + F1, faça o login e execute apt-get install gconf-editor
, então volte para sua tela com CMD + ALT + F7 ou às vezes F8.
Como alternativa, você também pode alterar isso com o comando gsettings.