Eu tive um problema semelhante com um controle remoto do media center do Windows. X estava pegando o remoto, bem como mythtv.
Se você está tendo o mesmo problema, você tem duas opções:
1) Diga ao X para ignorar o seu controle remoto.
2) Remova as teclas de seta do mapeamento lirc para mythtv para que X controle as teclas de seta e lirc controle o resto.
Infelizmente, esqueci a configuração para fazer (1). Espero que alguém possa guiá-lo ainda mais.