Se o problema é que a execução do script não mostra uma janela de terminal, a solução depende do gerenciador de janelas que você está usando. O Gnome e o KDE permitem editar as propriedades dos atalhos da área de trabalho clicando com o botão direito do mouse e definindo uma opção como "executar no terminal".
Outra maneira é editar o arquivo de configuração da área de trabalho manualmente: você pode encontrá-los no subdiretório Desktop
do seu diretório home. Basta adicionar uma linha com Terminal=true
ao arquivo de configuração da área de trabalho que deve executar o servidor.