Supondo que você tenha usado o Ubuntu Software Center, você pode remover e desinstalar clicando no botão "Remover".
Senão você pode abrir um terminal e colar: sudo apt-get purge e16
Como posso desinstalar o e16 do Ubuntu 10.04 Eu tenho o Gnome e o KDE instalados também, o que eu quero manter Obrigado