Você pode abrir um terminal e inserir:
sudo aptitude reinstall apache2
Isso deve trazer de volta os arquivos removidos e, se os arquivos forem alterados, será perguntado o que fazer com eles.
Como restaurar todos os arquivos apache2, quero dizer, quero definir os arquivos como os padrões do apache2. Como fazer isso?
Você pode abrir um terminal e inserir:
sudo aptitude reinstall apache2
Isso deve trazer de volta os arquivos removidos e, se os arquivos forem alterados, será perguntado o que fazer com eles.