Isso acabou sendo eu sendo impaciente. O controlador RAID do software precisa sincronizar as unidades após a instalação. Eu não estava dando tempo suficiente para fazer isso. Para unidades grandes (por exemplo, 1 GB ou mais), isso pode levar algumas horas. A reinicialização pode realmente interromper esse processo e fazer com que ele seja reiniciado assim que a inicialização terminar.
Para ver o progresso da sincronização da unidade, você pode executar
cat /proc/mdstat