No meu caso, o Chromium não estava iniciando o aplicativo, nem mensagens, apenas uma caixa cinza aparecendo onde o aplicativo estaria, então estava fazendo algo, mas não o suficiente. Que soa semelhante ao OP. Os aplicativos java que não são de navegador estavam sendo executados anteriormente no meu sistema.
Um artigo sugeriu usar which javac
para determinar o status da instalação. Isso não gerou saída de terminal. Então eu tentei apenas chamar o javac e peguei a lista de pacotes do instalador para o java. Então, acho que eu tive algum tipo de instalação limitada, não sei o que ou por quê.
Executou sudo apt-get install openjdk-7-jdk
e, em seguida, reativou o plug-in do Chromium icedtea (por meio de Configurações | Configurações avançadas | Privacidade | Configurações de conteúdo | Desativar plug-ins individuais) que eu havia desativado anteriormente enquanto tentava outras coisas. Não havia outros plugins Java na lista.
Ta-dah! Aplicativos Java agora trabalhando no Chrome. Não consigo me lembrar de como ou de onde instalei o Java anteriormente, mas era provavelmente uma abordagem de 'menor resistência', então suspeito que alguns outros também possam ter o mesmo estado do sistema.