Encontrei a resposta aqui:
% bl0ck_qu0te%Atualmente, estou usando o Cinnamon Desktop Environment, no qual tenho aplicativos que usam a bandeja do sistema, mas quando esses aplicativos são abertos, os ícones não são exibidos na bandeja do sistema, mas as notificações dos aplicativos aparecem.
Alguém já teve essa experiência e há alguma solução?