Eu acabei de instalar o kate , que é um editor de texto qt, no Ubuntu 17.10, e não tenho nenhum problema em usar o layout do teclado espanhol ao digitar.
Possivelmente você detectou algum tipo de bug Wayland, e então deve ser relatado como tal.
Considerando que o Ubuntu 18.04 será fornecido com as sessões do Xorg ativadas por padrão, e não o Wayland, você pode simplesmente começar a fazer login no 17.10 usando o Xorg a partir de agora como uma solução alternativa.