Depende do seu nível de habilidades.
Eu tenho dois sistemas:
-
anteriormente normal no Ubuntu 12.04 LTS com Unity e GNOME FlashBack, então eu atualizei para 14.04 LTS e depois para 16.04 LTS. No dia 16.04 eu instalei
ubuntu-mate-desktop
e cuidadosamente removi todas as coisas do GNOME e Unity manualmente. -
instalado como 11.04, em seguida, atualizado para 12.04 LTS com MATE PPA adicionado manualmente e, em seguida, atualizado para 14.04 LTS e 16.04 LTS. Após a última atualização, removi o MATE PPA e removi cuidadosamente todas as coisas do GNOME e Unity com a mão.
Ambos os sistemas 16.04 LTS resultantes com o MATE DE vão dormir e acordar sem problemas.
Eu sei pequenas diferenças do meu sistema MATE DE self-made em comparação com a MATE-edition - eu removi ubuntu-mate-welcome
e algumas outras coisas.
No seu caso especial, acho que você deve remover o gnome-screensaver
package com
sudo apt-get purge gnome-screensaver